De plaats is genoemd naar de vervener Jasper Klijn, of naar klijn, natte veenbrokken (zie: Turfbaggeren). Volgens Harm Tiesing zei men in plaats van 'Ik woon te Klijndijk' iets anders, n.l. 'Ik woon op de Zietak'. Dit slaat op het kanaal Odoorner Zijtak (1851-1868), dat van Klijndijk in westelijke richting naar het Oranjekanaal loopt, waardoor de plaats op het Drentse waterwegennet is aangesloten.